跨境电商出口模式可以分为以下四种：特殊区域出口（1210）、一般出口（9610）、跨境电商B2B直接出口（9710）、跨境电商出口海外仓（9810）；其中，特殊区域出口的增长态势尤为明显。
特殊区域出口
特殊区域出口又被称为保税备货出口，该模式依托于综合保税区等海关特殊监管区域开展，跨境电商企业享受入区即退税政策（保税区除外），提高了企业资金利用率，降低了物流成本。
一般出口
境外消费者下单付款后，相关企业将交易、收款、物流等电子信息实时传输给海关，海关审核该包裹的《申报清单》，查验后放行包裹，再通过国际运输、境外配送交予境外消费者。企业采取“清单核放、汇总申报”方式办理报关手续；跨境电子商务综合试验区内符合条件的跨境电商零售商品出口，可采取“清单核放、汇总统计”方式办理报关手续；对不涉及出口征税、出口退税、许可证件管理且单票价值在人民币5000元以内的商品，企业可以按照4位税号简化申报（通常为10位）。
跨境电商B2B直接出口
境内企业通过跨境电商平台与境外企业达成交易后，通过跨境物流将货物直接出口送达境外企业。
跨境电商出口海外仓
境内企业先将出口货物通过跨境物流运达海外仓（Overseas Warehouse），再通过跨境电商平台实现交易后从海外仓送达境外购买者。海外仓有自营型海外仓、第三方海外仓、亚马逊物流模式（Fulfillment by Amazon，简称FBA）三种类型。
9710及9810出口模式，货物可直达境外企业或先运至海外仓，待实际成交后发货，使物流成本大幅降低，终端价格随之下降；同时也便于国家精准识别、统计B2B出口模式数据，为商务、财政、税务、外汇等部门出台配套政策提供支持。